星露谷物语中共有8种宝石，包括绿宝石、海蓝宝石、红宝石、紫水晶、黄水晶、翡翠、钻石和五彩碎片。除五彩碎片外，其他宝石均可通过宝石复制机进行复制。这些宝石主要分布在矿井的不同层数，破坏矿井中的木箱和木桶也有概率获得。宝石在游戏中用途广泛，既可作为村民喜爱的礼物，也能用于制造物品或锻造武器。矿井位于小镇北面，每五层设有电梯，随着深度增加，矿石价值会提升。
绿宝石的矿点集中在矿井80层以上的绿宝石矿点和宝石矿点。海蓝宝石则出现在矿井40层之后的海蓝宝石矿点和宝石矿点。红宝石同样分布在80层以上的红宝石矿点和宝石矿点，紫水晶可在矿井各层的紫水晶矿点获取。黄水晶和翡翠的矿点分布与前述宝石类似，都需要在较深矿井层数才能发现。钻石作为高价值宝石，仅能在矿井50层及以上的钻石矿点生成。
五彩碎片作为最稀有的矿石，无法通过宝石复制机复制。其获取途径包括铱金矿点、神秘石、宝石矿点，或从万象晶球中开出。在姜岛火山第10层的稀有宝箱中也能获得1个五彩碎片。到达矿井底层后，所有怪物都有极低概率掉落五彩碎片，鱼塘饲养虹鳟鱼也有极小几率产出。
对于铱矿石这类高级资源，头骨山洞70层开始会出现铱矿矿点，每下降十层出现概率会提升。普通矿井的115-120层也会出现少量铱矿矿点。玩家可以通过破坏万象晶球和岩浆晶球获取铱矿石。采矿时建议优先向下挖掘以快速抵达深层矿脉，同时注意收集矿石和宝石。准备充足的食物补给和工具升级是高效采矿的必要条件。
采矿技能达到5级时，选择地质学家职业可使宝石成对出现的概率提升50%，这对宝石收集有很大帮助。矿井中的宝石矿点会随机刷新，建议定期查看。使用淘盘淘金或钓鱼时开启宝箱也是获取宝石的补充方式。冬季第25日的冬日星盛宴活动中，玩家可能收到宝石作为礼物。
