宝箱分布在黑塔空间站、雅利洛-Ⅵ和仙舟罗浮三大区域，每个区域都有不少隐藏的奖励等待发现。在黑塔空间站，宝箱主要集中在基座舱段、收容舱段和支援舱段。基座舱段有10个宝箱，分布在传送点附近，其中部分需要击败怪物才能解锁。收容舱段1层和2层共有多个宝箱，有些藏在特殊解析室或露台角落。支援舱段的宝箱则分布在电力室、备件库房等位置，部分需要完成前置任务才能开启。
雅利洛-Ⅵ的宝箱数量较多，行政区、城郊雪原、边缘通路、铁卫禁区、残响回廊、永冬岭、磐岩镇、大矿区、柳钉镇和机械聚落都有分布。行政区的宝箱藏在歌德宾馆附近、中央广场长椅旁，甚至地铁口处。残响回廊的宝箱需要检查电路结构或击败守卫怪物，而大矿区的宝箱则散落在街道角落和建筑内部。
仙舟罗浮的宝箱集中在长乐天、流云渡、回星港、太卜司和工造司。长乐天有7个宝箱，分布在亭子下方和守卫附近。流云渡和回星港的宝箱有的需要操控装置移动箱子，有的藏在岩石后方。太卜司和工造司的部分宝箱涉及特殊解密，比如魔方解密完成后会刷新宝箱位置，还有需要现实时间推进的解密，比如流云渡的时刻表和太卜司的绘星。部分宝箱需要完成特定任务或对话才能解锁。比如流云渡的时刻表宝箱，需要在第二天找梓桥对话，第三天找子衿对话。工造司的公输师傅任务也需要分阶段完成。耐心探索每个角落，一定能集齐所有宝箱！
