部分BOSS的击败与否直接影响支线任务的推进或结局分支。碎星拉塔恩、满月女王蕾娜菈、黑剑玛利喀斯以及女武神玛莲妮亚是关键节点。这些BOSS的挑战结果会解锁特定区域、触发NPC剧情或改变世界状态，进而决定支线任务的后续发展。击败碎星拉塔恩后，陨石坠落将开启永恒之城诺克隆恩的入口，这是菈妮支线的重要环节。而满月女王蕾娜菈的击败则是进入王城的前置条件，影响多条支线的阶段性进展。
黑剑玛利喀斯的击败会直接导致王城变为灰城，部分支线任务因此中断或无法回溯。菲亚的支线需要在击败黑剑前完成，否则其关联的死眠少女剧情将无法推进。女武神玛莲妮亚则与米凯拉的锋刃支线紧密相关，她的战败会解锁圣树区域，并影响部分NPC的后续对话与奖励。这些BOSS的设计并非单纯战力考验，而是支线叙事的重要枢纽，需谨慎规划挑战顺序。
癫火之王三指相关的BOSS战同样影响深远。若在触发癫火结局前未完成其他支线，如菈妮的群星时代或菲亚的死诞者结局，这些分支将永久关闭。部分区域BOSS如仿身泪滴、黑暗弃子艾斯提等虽非主线必需，但击败后可获得关键道具，用于解锁NPC任务的后续阶段。仿身泪滴的追忆可兑换强力骨灰，而黑暗弃子关联瑟利亚隐藏魔法师的支线。
菈妮支线需依次击败碎星、灾厄影子等BOSS，并获取暗月戒指才能推进；瑟濂的魔法师支线则要求玩家在满月女王战后选择是否支持她的研究。这些BOSS战的安排并非随机，而是与世界观设定和角色命运深度绑定。玩家需通过探索与对话线索，明确BOSS战对支线的具体影响，避免关键节点遗漏。
部分隐藏BOSS如死龙弗尔桑克斯、鲜血君王蒙格等虽不影响主线，但会提供支线任务的特殊奖励或结局分支。蒙格的击败可提前进入鲜血王朝区域，获取大量强化素材；死龙弗尔桑克斯则关联菲亚支线的最终阶段。这些BOSS的挑战需结合NPC剧情进度，盲目推进可能导致支线断联。
